2003年和2006年，学校相继出台《宁波大学2020年学科建设与发展规划》、《宁波大学“十一五”学科建设与发展规划》，标志着“新世纪学科建设工程”全面铺开。2007年，根据学科发展需要，学校对“十一五”学科建设方案做了调整，重点扶持“优先发展学科”和“重点发展学科”，以加快形成学校学科特色和学科优势，学科建设与科学研究成为2008年以后学校加快建设创新型地方高校，实现由教学型大学向教学研究型大学转换的重要抓手。
