我国血吸虫病流行区分布于长江流域及其以南地区。截至2013年，曾有过血吸虫病流行的为上海、江苏、浙江、安徽、福建、江西、湖北、湖南、广东、广西、四川、云南等12省（直辖市、自治区）的454个流行县（市、区）。由于行政区划的调整，流行县的数量年间有所变化，但流行范围没有实际变化，这是广义的血吸虫病流行区概念。其中广东、上海、福建、广西和浙江等5省（直辖市、自治区）于20世纪末期先后达到传播阻断标准，这5个省称为传播阻断地区；而江苏、安徽、江西、湖北、湖南、四川及云南等7省称之为流行省，也就是狭义的血吸虫病流行区概念。

新中国成立初期，全国血吸虫病流行区疫情类型复杂，疫情轻重分布不平衡，流行因素复杂多变，血吸虫病监测主要以疾病监测（流行病学调查）为主要手段，开展了以疾病发生、转归、死亡为主要内容的监测性查病、查螺工作，为救治病人及控制血吸虫病流行提供了可靠依据。通过这一阶段的疾病监测，掌握了不同地区和不同流行类型血吸虫病分布特征、规律和趋势，为制订防治策略和干预措施提供了科学依据。

由于血吸虫病是一种易反复的寄生虫病，只要稍有松懈或监测巩固措施不力，疫情就会反复。因此在广东、上海、福建、广西和浙江等5省（自治区、直辖市）于20世纪末期先后达到了血吸虫病传播阻断标准后，卫生部于1995年及时制定下发了《达到消灭血吸虫病标准地区的监测巩固技术方案》，2000年根据新情况修改完善为《血吸虫病传播阻断地区监测巩固方案》，重点为消除当地遗留传染源和残存钉螺，严防外来传染源和钉螺输入。

各有关省份按照方案要求，针对传播阻断地区的潜在流行因素，开展了以螺情监测（当地或输入）、病情监测（人畜和野生动物）等为主的疾病监测，做了大量卓有成效的巩固工作，结果除广东省于1992年在佛山市迳口农场发现1个残存螺点，并检出2例当地新感染病人外，其他4个省份均未发现当地新感染血吸虫病人和病畜。但监测结果也提示，血吸虫病重新传播和流行的因素仍然存在，表现为：一是输入性血吸虫病例时有发生，且呈上升趋势；二是除广东省以外，其余4个省份均出现了不同程度螺情回升，且钉螺孳生环境仍然存在。

目前，广东、上海、福建、广西和浙江等5省（自治区、直辖市）达到传播阻断标准时间已有20～30年，进入远期监测阶段，监测和巩固工作向纵深发展，监测任务将越来越艰巨，当前应积极采取“查灭残存钉螺和防控外来传染源为重点的综合性巩固策略”，以进一步巩固血防成果。

为评估气候变暖、水利工程等可能导致的血吸虫病传播扩散与流行风险，卫生部制定了《全国血吸虫病潜在流行区2008—2012年监测与研究方案》，在江苏、山东、安徽、湖北、重庆等5省（直辖市）的10个非血吸虫病流行县设立了血吸虫病潜在流行区监测点，主要通过对可疑环境、流动人畜等进行调查，开展输入性钉螺和传染源监测，结果显示潜在流行区已有血吸虫病传染源输入，外源性钉螺扩散输入的可能性较大，这一结果为明确潜在流行区的工作重点，有效降低血吸虫病传播风险提供了依据。