梗死后不同时间点的心肌微环境，对骨髓干细胞存活、归巢及分化影响较大。急性期因心肌损伤区炎症反应强烈，此时微环境不利于干细胞存活生长。急性心肌梗死时干细胞移植理想条件为：①损伤区炎症反应基本消退；②损伤区形成一定量的幼年毛细血管；③尚未开始瘢痕形成的病理过程。这样可使移植干细胞有一个较好的微环境，有利其迁移、生存、归巢和转化。研究发现在急性心肌梗死第1～4天为炎症反应高峰期，第7天时一些对干细胞迁移有利的细胞因子(如血管内皮生长因子)达到分泌高峰，14天左右梗死区瘢痕开始形成，20天后梗死区的肌性血管壁将形成。综合随机临床试验结果，建议在心肌梗死发生后7～8天进行干细胞移植 ^{[5，14，20，21，23～26]}。此段时间为干细胞移植的相对最佳时间窗口，有利于骨髓干细胞有效迁移到梗死区域，并能在炎症干扰较小、生物因素有利的微环境中开始分化过程。但至今为止，急性心肌梗死后的理想干细胞移植时间尚不完全清楚，既往有研究提出不同的移植时间及理由 ^[41，42]；在今后的临床研究中，要继续深入探索这一问题。

无明显时间窗问题，可选取患者一般状态较好(如无心绞痛发作和一般体力活动无不适，即心脏供血与心功能尚佳)、提示人体内环境和细胞微环境较好的时段进行移植治疗，以利植入细胞的存活、归巢与分化。

虽然心力衰竭是心脏疾病终末期的共同病理生理状态，但具有不同的病因与病理解剖特征，这对于干细胞移植的时间、细胞数量和疗效可能具有不同意义。心力衰竭时全身一般状况和各器官状况既关系着骨髓干细胞的数量和质量，也与人体内环境和细胞微环境直接相关，而干细胞归巢靶器官的状况则对干细胞生存、分化及能否发挥生物学作用至关重要。目前心力衰竭的干细胞移植无严格时间窗，但接受移植治疗的患者几乎均为心力衰竭终末期，原则上应在患者一般状态尚稳定的情况下尽早实施。建议今后在研究中积极探索不同病因所致心力衰竭中最佳细胞移植时间的客观指标。

移植无最佳时间窗口，原则是尽可能在进入心力衰竭终末期之前实施。但须考虑本病的人体内环境与细胞微环境对移植干细胞的影响，要求患者在细胞移植前至少2周心功能相对稳定，一般状态较好，同时确认不存在感染或未经处理的隐性感染。

心脏瓣膜病患者实施干细胞移植的目的是为使手术前的心脏处于相对良好的状态以便增强对手术的耐受力，同时也为术后心脏的恢复创造一个较好的内环境。无明确时间窗，宜选择患者一般状态较好、心功能较佳且溶血性链球菌感染已良好控制的时段。