ECMO的管路是由不同尺寸内径的PVC管组成。按照患者年龄的不同，各个ECMO中心准备的管路尺寸也不大相同。一般情况下，新生儿选用内径为1/4英寸（1英寸=2.54cm），儿童和成人选用3/8英寸。

ECMO管路通过插管与人体相连，血液在管道内流动，相当于放置于体外的“血管”。相对于人体，管路和其他的与血液接触的装置都可视为异物，血液与异物接触后就可激活血小板、补体以及其他炎性介质。因此，管路中最重要的部分就是表面涂层。不同种类的表面涂层既可以减少补体、血小板以及其他炎性介质的激活，也可以减少血栓的形成。按照种类可分为肝素涂层和非肝素涂层两大类。整个ECMO系统中，血液与异物接触的表面积越大，血栓生成的几率就越大。血液在管道中流动受到的阻力与长度成正比，管路越长，液体的预充量就越大，热量的损失也越大。因此，管路越短越好。最适的管路长度应当刚好够从泵到患者的距离，满足患者在运送过程中的安全。另外，尽量减少接头的数量，在这些接头处往往容易形成湍流，增加了血栓形成的几率，也容易造成红细胞的破坏。要注意接头的密封程度，防止接头脱落的发生。

ECMO插管是管路与人体连接的最后一段，其内径的大小直接影响进入体内的血流量。因此，为了确保进入人体的血流量，插管内径越粗越好（图2-2）。一般情况下，泵的流量应保持在60～120ml/（kg·min）。插管的外径以法制单位（F）来表示，不同厂家生产的相同规格的插管，内径可能并不相同。M系数（M-number）用来代表阻抗因素，根据长度、内径和侧孔位置来描述插管的流量-压力特性，估算某一压力时的预计流量，测定各种规格插管的阻力。插管的选择要尽可能地使用内径大、长度短的引流管，因为静脉引流靠重力或是虹吸作用实现。现阶段，各个ECMO中心大都根据Egleston的Atlanta儿童医院的使用方案进行选择（表2-1）。