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第五节 网上医学资源的检索
Internet是目前世界上最大的共享信息资源库，也是最大的信息交换网络。1986年，美国国家科学基金会（NSF），采用因特网（Internet）技术开发电脑网络供学术界使用，随着Internet在医学领域的普及和广泛运用，它对推动和促进医学事业发展的巨大价值也日益体现。到今天Internet已经遍及全球近百个国家和地区，而且Internet上各种信息的注入速度日益增长。Internet对医学的影响和重要性不言而喻，了解Internet的基本知识、掌握一些获取医学知识和信息的Internet技术已成为广大医务工作者的当务之急。但要在渺如烟海的Internet中找出自己所需的信息并不是一件容易的事，为使大家更好地掌握Internet，利用它强大的网络功能进行各种医学信息的搜寻和获取，加快知识更新、扩大和国外先进技术的交流，现在介绍Internet上的医学资源及查找方法，并列出一些常用医学网址供大家参考。
一、Internet上的医学信息资源查寻导航
Web上的医学专业搜索引擎和免费检索节点：由于Internet上信息资源极为丰富而且还在快速地增加，刚刚踏入Internet世界的人面对这浩如烟海的知识宝藏往往茫然不知所措，令人无从下手。因此掌握几个好的专业搜索引擎能使我们少走很多不必要的弯路，快捷地找到自已需要的信息。下面列出几个常用的专业引擎供大家参考选用。
（一）Medline检索
Medline 数据库是美国国立医学图书馆提供的规模最大、权威性最高的著名医学文献数据库。众多的医疗机构通过Internet提供免费Medline检索，常用免费Medline检索的网上节点有：PubMed
网址：http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
（二）HealthAtoZ
网址 http：//www.healthatoz.com
HealthAtoZ是一个功能强大的Internet医学信息资源搜寻器。收集的内容每周进行更新，信息经过医学专业人员的人工编排，可按分类及关键词的方式进行检索。同时它提供上千个医学讨论组，可选择感兴趣的申请参加。
（三）Medical Matrix
网址 http：//www.medmatrix.org
Medical Matrix是一个大型医学信息搜索工具，内容全面更新快。它的特点是提供免费Mailing Lists，只要订阅了它的邮件列表，即可定期收到网上新增医学节点的通知和其他有关信息。
（四）Med Mark
网址 http：//www.Medical marks.org
Med Mark在线医院及医学资源搜索，有分类检索和关键词检索两种检索方式，并提供其他搜索工具的链接。
二、PubMed
（一）PubMed简介
PubMed是一个免费的搜寻引擎，是因特网上使用最广泛的免费MEDLINE，是美国国家医学图书馆（NLM）所属的国家生物技术信息中心（NCBI）于2000年4月开发的。提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要。其数据主要来源有：MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等。数据类型：期刊论文、综述以及与其他数据库链接。收录范围广、内容全，包括医学及其他与医学相关的领域，如生物化学、分子生物学、细胞生物学、护理学、其他健康学科。检索途径多、数据更新快、检索系统完善、访问速度快等。提供了强大的查寻功能，用户可以非常容易地在普通检索界面内进行检索，且普通检索界面可以支持布尔逻辑组配，执行高级检索界面功能。是广大医务工作者和图书情报人员的首选网上检索系统。PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能、侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。提供检索词自动转换匹配，操作简便、快捷PubMed的资讯并不包括期刊论文的全文，但可能提供指向全文提供者（付费或免费）的链接。
OLDMEDLINE：含1950～1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要，记录的标记为：[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]。
1.Journal Database
可通过输入期刊刊名、ISSN或Medline刊名缩写查询期刊的出版资讯。
2.MeSH Database
点选此功能后，在检索栏位中输入欲查询的词汇，可浏览PubMed资料库中所使用控制词汇。
3.Single Citation Matcher
使用栏位化的检索方式，找寻特定刊名、卷期、作者、篇名的文献资料。
4.Batch Citation Matcher
以指令式的方式批次检索资料库中相关的文献，只要输入刊名、年代、卷期、起始页、作者名、关键词其中部分栏位资料即可。
5.Clinical Queries
临床病理资料，本功能提供临床病理资料之查询，并依Haynes RB等专家所制订的最佳化检索策略之机制，使用者可先行选择检索方向，如：治疗方式（Therapy）、诊断方式（Diagnosis）、病因（Etiology）、预后状况（Prognosis）其中的一类，并可选择预期之检索结果是较具相关性（sensitivity）或精确率（specificity）较高的。
6.LinkOut
LinkOut为PubMed提供使用者连接外部网路资源之功能选项，连接内容包括国外图书馆馆藏目录、线上电子全文、书目资料库清单、消费者健康资讯、研究参考资料等资讯。如有外部资源的连接，使用者可在PubMed摘要书目中看到LinkOut此一选项。
7.免费个人化检索服务—My NCBI
在MY NCBI服务页建立个人检索账号/密码后，即可使用个人化检索服务，该服务提供储存/删除检索结果、My LinkOut设定及文献传递等个人化服务。
PubMed是NCBI Entrez数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务，MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据等。
PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA与蛋白质序列、基因图数据、3D蛋白构象、人类孟德尔遗传。
PubMed-cn为丁香园旗下网站，专业的医学文献数据库，其数据每天与美国的NCBI数据中心同步一次。用户在检索文献时，可以立即看到该文献影响因子，用户可以在期刊数据库查询影响因子变化趋势、投稿指南、投稿经验等相关的信息。并且PubMed-cn提供国家自然科学基金查询，分析各个地区中标率，热门学科，是申请NSFC的好帮手。
（二）PubMed检索方法
在检索文本框中输入一个或多个词语，然后按回车键或用鼠标点击“Search”按钮，PubMed就会利用“自动词语匹配”功能将重要的词或词组用“AND”组合在一起进行检索。也可使用MeSH/副主题词组配格式（MeSH即美国国立医学图书馆编写的医学主题词表）进行检索，如：neoplasms/diet therapy[mh]。
“Automatic Mode—自动词语匹配”是检索系统将输入的检索词根据MeSH注释表、期刊名注释表、常用词组表和作者索引进行自动匹配的一种方式（图1～图16）。
图1
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图16
1.MeSH注释表
MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参照（也称款目词）、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词，则该词将被作为MeSH词和自由词（即textword）同时进行检索。
例如：如果输入Vitamin h，PubMed则会这样检索：（“Biotin[MeSH]OR Vitamin h[tw]）——vitamin h是MeSH词Biotin的款目词。
2.期刊名注释表
可以输入期刊名全称检索，如Molecular Biology of The Cell；期刊名MEDLINE缩写名称检索，如mol biol cell；或ISSN号检索，如1059-1524。
如果期刊名称正好是医学主题词表（MeSH）中的词，例如genetherapy、science、cell等，PubMed会将其当作MeSH词进行检索。因此，在此种情况下应使用期刊名称检索字段标识[ta]，如genetherapy[ta]。
如果期刊名称是一个单词，也需要使用期刊名称检索字段标识，如Scanning[ta]，否则会在所有字段检索该词。
推荐使用期刊名称全称或MEDLINE缩写形式检索期刊。
需要注意的是，在以前的引文中，ISSN号是不能保证的。
3.常用词组表
如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词，PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表，例如cold compresses。在词的右半边加*号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有词，例如，staph*，但不包括*号后有一个空格的词组，譬如，infection*包括infections，但不包括infection control。此外，截词检索将关闭自动词语匹配功能，也不能进行扩展检索。如：heart attack*不会匹配MeSH词，也不会扩展检索myocardial infarction、myocardial stunning、shock、cardiogenic这些方面的文献。
4.作者
输入作者姓名时应采用姓+名（名的首字母缩写，不用标点符号）的格式，例如Smith JA。PubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。如果只输入作者的姓，PubMed会在包括作者姓字段在内的所有字段进行检索，例如只输入Li，则PubMed将像下面一样检索：Yang-Li或Yang。此外，如果使用双引号“”将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来，并用作者检索字段标识符[au]限制，如“Smith J”[au]，PubMed将关闭自动截词，且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。
如果输入的检索词在以上词表中均未找到，且该词后有一或两个字母，PubMed就会查检作者索引。如果在作者索引中仍未找到匹配词，PubMed就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词，PubMed将该词组的每个单词用“AND”组配并在所有字段中查找。
5.截词检索 6.每页显示的文献数量
PubMed将检索出的文献记录按每页20条显示（缺省值）。要改变缺省值，单击“number of documents to display per page”下拉菜单，并选择一个更大的值。
7.检索时间范围限制
使用“entry date limit”下拉菜单可限制检索时间范围。“entry date”是引文追加到PubMed数据库的日期。引文以文献记录入库时间顺序显示（倒序）。
8.检出文献记录显示格式
使用“abstract report”（PubMed缺省显示方式）下拉菜单可选择文献记录显示形式。
（1）文摘报告：
包括期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘（如有）、出版类型、PubMed和MEDLINE登记号等。
（2）引文报告：
期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘（如有）、出版类型、MeSH词、资助号、PubMed和MEDLINE登记号等。
（3）MEDLINE报告：
MEDLINE记录格式，采用两个字母的文献记录字段标识符。
9.PubMed检索规则与语法
（1）布尔运算符AND，OR，NOT必须大写，例如，vitamine OR zinc；
（2）PubMed从左至右进行布尔运算。可以通过加圆括号改变运算顺序，如common cold AND（vitamine OR zinc）；
（3）指定文献记录字段名称检索，如dna[mh]AND crick[au]and1993[dp]。下面列出常用字段名称缩写：
DP——出版日期采用YYYY/MM/DD[DP]格式，如1998/03/06[DP]。输入日期范围则用冒号连接，如1996：1998[DP]，1998/01：1998/04[dp]
AD——第一作者机构名称、地址、资助号，如LM05545/LM/NLM[ad]
AU——作者姓名如o’brienj[au]
TA——期刊名称包括期刊名全称、简称、ISSN。J Biolchem[ta]或0021-9258[ta]
LA——文献出版语言Chinese[la]
MH-Mesh主题词neoplasms[mh]或neoplasms/dt[mh]
PT——出版类型review[pt]
TW——自由词AA001794[tw]
T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma[ti]
（4）经常通过单击Details按钮观察PubMed怎样运算你的检索策略，并不断修正检索策略，以达到最佳检索结果。
10.提供部分免费全文服务
PubMed在提供部分期刊的免费全文，在文献检索结果记录中，有些记录出现有彩色标记的期刊名称缩写按钮，用鼠标点击该按钮，将可能免费获得该记录的全文。
三、其他Internet生物医学信息检索
（一）HEALTHGATE（http：//www.healthgate.com/HealthGate/MEDLINE/search.html） 1.普通检索界面
在检索窗口键入关键词、主题词、作者名、基因符号、时间、词组或含布尔逻辑的检索式，按下检索按钮，就可以得到以这个概念为中心的MEDLINE中的文献。此页面只能检出过去两年内的最新文献。
2.高级检索界面
READER（编译器）打开，在检索窗口键入能代表检索要求的概念或词，编译器会自动将自由检索词转化为恰当的索引短语、检索命令或特定数据库的特定检索式。高级界面中有多个选择项，可对检索做进一步限定，而每种限定中又有“AND”“OR”逻辑选项，可以与标题或文摘中出现某个词的文献进行逻辑运算，也可以与某个作者的文献进行运算。还可以限定Pertaining to humans（与人类相关）、from...to（时间范围）、Age Groups（年龄组）、Journal subset（期刊子集）、Article type（医学文献的类型）等多个选项。
3.检索结果
按用户的设定显示检出文献的数目，为了加快速度，先不显示文摘，用户对检出的文献做进一步选择，确定要套录的文献，再按下Retrieve Selected References，就能在屏幕上显示命中文献的摘要格式。
（二）Evaluated Medline（http：//www.biomednet.com/db/medline） 1.检索界面
除一般的检索选项外，检索界面下方有以前检索的历史记录，用户可根据需要对其进行逻辑组配，实现新的复杂检索。这一功能是Evaluated Medline的重要特色。
2.特点
实现了文献记录和电子期刊全文之间的相互链接，当MEDLINE中的一条文献被Citation WebTM系统中所收录的文章引用时，将从MEDLINE数据库中的文献指引到引证文献。
浏览期刊目次表：可浏览1959年以来7000余种期刊的目次，可使检索限定于某一特定的期刊或某一特定的卷。
医学主题词表MeSH：允许使用所有的MeSH词限定检索策略。
BiblioteKTM技术：一般查询引擎不能处理像“a”“the”等词，而BiblioteKTM技术将MEDLINE中的每一个词都进行索引，能返回正确的检索结果。所有字段的检索，截词检索和布尔运算符的使用可以满足特定的检索需求。
相关记录检索：可检索密切相关的20条记录。
可对检索史进行逻辑组配。
可进行位置逻辑检索。
3.注意事项
默认的逻辑组配符为“OR”；“*”代表中间或末尾的任何匹配字符，“？”代表匹配的1个字符；可对选择的记录进行存贮和对全部记录进行存贮（一次可存贮的最大记录数是500个）。
（三）其他免费MEDLINE资源
Infotrieve Medline Service Provider
Avicenna Medical Information Services
Medlcape Medline Search
Knowledge Finder
Helix Medline Access
Internet Medline Comparison Table at Medical Matrix
Ovid On Call Medline and Medical Databases
MD Answers at Silver Platter
Paper Chase Medical Literature Searching
MedEc Interactive Medline
Community of Science，Inc.
（四）网上生物医学电子期刊 1.概述
网上电子期刊的问世，为人们在网上获取所需信息提供了又一重要途径。它不但具有同印刷型刊物相同的图文界面，而且出版快，并且可以进行关键词、作者等途径的查询。通过超链接，可选择不同的卷、期，经参考文献链接至被引文献等，甚至还可链接至编辑部，了解征文要求，直接向编辑部投稿，交换信息。目前，网上电子期刊大部分提供期刊目次，少部分提供摘要，极少部分提供免费全文服务。
2.获得网上生物医学电子期刊的途径
通过医学资源指南和查询引擎：如：Emory Med Web Electronic Publications（http：//www.medweb.emory.edu/）；哈佛大学虚拟图书馆的电子期刊导航（http：//mcb.harvard.edu/BioLinks.html）
通过一般主题指南和查询引擎：有些期刊在医学索引中找不到，但一般搜索引擎中可能会有。
通过国内医科大学或机构网页上提供的电子期刊导航：如：中国医科大学图书馆生物医学电子图书馆（http：//www.cmu.edu.cn/）；上海医科大学图书馆医药电子期刊导航（http：//www.shmu.edu.cn/library/ej.htm）
通过印刷品期刊查找：印刷品上往往有其电子期刊的网址，有的还向用户提供免费访问的方法。
3.利用网上电子期刊全文的方法
网上传输数据的标准格式是超文本标记语言（html），有时电子期刊亦采用PDF文件格式。在html文件中，图表是采用不同的文件进行存贮的，需进行超文本链接才能传输过来，故用户打印期刊全文时，通常只能打印出文字，不能打印出图表；PDF格式解决了这一问题，但需要专门的软件Adobe Arcobat（可到Adobe公司下载）。
4.部分全文生物医学期刊网址
期刊名称和网址：
Proceedings of the National Academy of Science http：//www.pnas.org/
Science http：//www.sciencemag.org/
BMJ http：//www.bmj.com/
Journal of American Society of Microbiology http：//journals.asm.org/
Journal of Biological Chemistry http：//intl.jbc.org/
Journal of Clinical Investigation http：//INTL.jci.org/
The New England Journal of Medicine http：//www.nejm.org/
American Journal of Physiology http：//ajpcon.physiology.org/
American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine http：//www.ajrccm.org/
附：部分医学网址
医学检索网站：
http：//www.medmatrix.org/index.asp
http：//www.healthatoz.com
http：//www.medexplorer.com/m-publi.htm
http：//igm.nlm.nih.gov/index.htm
http：//biomednet.com/db/medline/index.
http：//www.infotrieve.com/freemedline/index.htm
http：//www.medscape.com/misc/formmedlineInfLive.html
http：//www.avicenna.com/index.htm
http：//www.kfinder.com/index.htm
http：//www.helix.com/index.htm
http：//www.healthgate.com/HealthGate/MEDLINE/search.shtml
http：//www.medmatrix.org/info.medlinetable.asp
http：//preview.ovid.com/libpreview/
http：//php2.silverplatter.com/physicians/
http：//www.cc.emory.edu/WHSCL/medweb.ejs.html
http：//enterprise.bih.harvard.edu/paperchase/
http：//www.medecinteractive.com/
http：//muscat.gdb.org/repos/medl/
虚拟医院
http：//www.tiac.net/users/jtward/多媒体虚拟医学图书馆
http：//www.vh.org/美国依阿华州医科大学虚拟医院
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解剖
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麻醉
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心脏病
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影像
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http：//micro.ifas.ufl.edu/nmr.html磁共振网络资源指南
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儿科
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美国弗吉尼亚大学儿童医疗中心
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儿科特殊病例研究
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http：//www.ama-assn.org/美国医学会杂志
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http：//www.med.ufl.edu/medinfo/pcnews/家庭医学电子杂志
http：//www.scar.rad.washington.edu/ScarStuff/JDI.html医学数字图像杂志
http：//micro.ifas.ufl.edu/磁共振成像杂志
（李 欣）