除了海马，其他脑结构也参与压力的神经环路，包括杏仁核和前额皮质。杏仁核是涉及情感加工和恐惧反应的重要边缘结构，可联系皮质和皮质下结构。莱朵克斯（LeDoux，1998）发现，机体的恐惧反应与杏仁核有关，杏仁核将学习得到的感觉信息结合到适应反应（搏斗或逃跑）中去，使机体作行动的准备（如心排出量从胃肠道转向肌肉，应激激素涌进血流以提供能量）。这些活动的发生先于脑的“思维”部分（涉及大脑皮质中的海马）对威胁的估量，说明杏仁核在这里起着“拦路抢劫”（hi-jacked）的作用。因此他提出杏仁核是躯体表达的陈述部位，它对任何与创伤匹配的远隔问题，不需要经过大脑皮质察觉和作出决定，就可激活恐惧反应。杏仁核在调节应激反应和情感学习方面的功能提示这一区域的变化还不清楚，功能影像研究提示创伤下PTSD患者表现为杏仁核过度反应性，及其他的创伤提醒。有实验报道在恐惧获得时PTSD患者的杏仁核活动增强。增强的杏仁核反应性与基因特征有关，也是PTSD的生物学危险因素之一。