分子遗传学的发展使从基因水平研究本病的发病机理成为可能，来自家庭和双胞胎的越来越多证据表明PTSD受遗传因素的影响。例如，研究认为多巴胺转运基因是PTSD的危险因素，创伤的存活者中发现SLC6A3等位基因的串联重复多态性。而Comings Young等（1996）对PTSD与多巴胺受体D2 （DRD2）TaqⅠ多态性的关系进行了研究，均发现PTSD患者中A1等位基因的频率显著高于有战争经历而未患病的同期参战军人，且PTSD的核心症状严重程度与A1等位基因频率显著相关。还有许多证据认为5-HTTLPR的所谓“S”等位基因的低表达与生活应激相关性抑郁症的发生有关，相同的变化也见于PTSD患者，尤其是那些低社会保障者。此外，Binder等（2008）的最近研究发现：糖皮质激素受体FKBP5的基因变异与儿童受虐后发展为PTSD有关，FKBP5p基因多态性强烈预示受虐儿童发展为成年PTSD。