不同于ES和iPS细胞具有形成畸胎瘤的潜在风险且对部分受试者存在伦理学争议，成熟干细胞已被认为可为多种疾病的再生治疗方法。事实上，内膜和经血中的干细胞已被成功运用于多项人类疾病的试验模型。治疗方法包括直接提供纯化的内膜或经血干细胞，或体外预先培养、分化为治疗所需细胞类型后替换伤病组织。临床前治疗应用的突出例子包括在啮齿类动物模型将其子宫内膜干细胞的保护功能用于心肌梗死、卒中、Duchenne型肌营养不良症、严重肢体缺血、帕金森病和1型糖尿病等。针对多发性硬化症患者的前沿性研究表明，应用月经血提取的干细胞进行治疗安全且潜在有益。需注意，NIHs公共数据库ClinicalTrials.org列出了多条临床试验宣告（部分是招募），目的在于评价内膜或经血成熟干细胞的安全性与治疗效果，针对疾病包括子宫内膜异位症、1型糖尿病、重度肢体缺血和肝硬化。这项进展令人振奋，有望为今后不育及低生育力患者的治疗打下基础。在此背景下，获得更深入的关于干细胞在子宫内膜异位症发病机制中的了解十分关键。此外还考虑将干细胞用于产生子宫与内膜组织。例如，Cervello等提出子宫内膜干细胞使内膜再生的能力可用于Asherman综合征患者的内膜再生，此类患者因宫腔完全粘连而闭经、不育。近期报道了一例严重Asherman综合征患者利用自体成熟干细胞使内膜再生后经体外受精成功妊娠的病例，获得巨大的关注的同时也为内膜干细胞的临床应用提供了证据。但是，此项研究也引发了一些关于移植细胞的本质及刮除术诱导的内源性子宫内膜前体细胞活性的问题。还需更加全面、深入的研究来评估成熟干细胞用于不育的潜在治疗作用。

内膜干细胞的临床应用总结如下：

1.子宫内膜干细胞功能失调可能是子宫内膜异位症的发病因素之一，与内分泌治疗抵抗有潜在关系。

2.内膜与经血中的干细胞可作为Asherman综合征患者的治疗性细胞。

3.失调内膜干细胞的诱导分化可在将来作为子宫内膜异位症的治疗方法。