黄酒酿造中复杂的微生物群落结构对黄酒自身的品质有着重要的影响，因此微生物的群落结构、代谢特征以及功能特性一直备受关注。目前国内已经对黄酒酿造过程中所用到的麦曲、酒药、酒母、发酵醪和坛酒等体系中的微生物群落及代谢特性进行了一定的研究，获得了酿酒酵母、黄曲霉等纯种微生物用于黄酒酿造。但对于微生物在黄酒酿造过程中的动态变化监测，以及微生物群落与风味等的交互作用机理仍需要进一步研究。
