中药用药配伍禁忌的方法主要有传统文献研究方法、数据库方法、数据挖掘方法，以及实验研究和临床调研等方法。传统文献研究方法如版本、校勘、训诂等考证，是中药配伍禁忌研究中必不可少的基本方法，有助于在传统医药宝库中认识中药配伍禁忌理论特点；借助于现代科技尤其是计算机技术对历代方剂、中药、临证等数据进行挖掘，可以发现其中潜在知识；现代实验方法如毒理学、化学、分子生物学的研究可以更客观、深入地认识配伍禁忌内涵和规律。
