SHPT患者骨骼系统早期无明显症状，晚期可有：

骨痛是最常见的症状，常发生在承重骨，足跟、髋骨、腰、背等部位，可伴明显压痛。初期仅表现为骨骼疼痛，伴随肌无力，晚期四肢活动及肌力明显受限，表现为下蹲困难、上下楼困难和“鸭子样步态”的行走困难等，疼痛进行性加重逐渐延至全身。骨折多见于肋骨、脊柱、髋部等，椎体压缩骨折可导致脊柱侧凸、胸廓变形缩小、鸡胸驼背、身高缩短，严重者可出现退缩人综合征。突然的胸痛可能为肋骨骨折，多见于骨质减少症和软骨病患者。

骨骼变形可发生于有肾性佝偻病的儿童及严重骨病的成人，长骨变弯，多个椎体的骨折可致身材变矮，脊柱侧弯，驼背，腰椎骨折。上颌骨、下颌骨和/或颧骨增生，出现头面部狮面样畸形，常同时合并构音及听力障碍、胸廓脊柱畸形、身高缩短，严重者可出现呼吸困难和病理性骨折，也称Sagliker综合征；儿童可出现骨生长延迟，生长受限，骨骺脱离和股骨变形；SHPT骨病大多表现为高转换性骨病，因此，PTH、骨特异性碱性磷酸酶和抗酒石酸酸性磷酸酶5b是SHPT骨病常用的骨代谢标志物，其升高程度与骨病严重程度常一致。

部分患者还可能出现自发性肌腱断裂，儿童和青少年患者还可出现生长发育停滞。