实验室在抗菌药物管理中的作用
微生物实验室在许多促进抗菌药物合理使用的行动中发挥重要作用。尽管抗菌药物管理团队的构成在不同国家可能存在差异，但通常医学微生物学家是团队的核心成员，他们与实验日常工作紧密结合，包括：重要结果的报告，建议如何进行最适合的实验检验，推荐抗菌治疗方案，制定指南并参与督导。另外实验室也参与地方及更高级别的耐药监测，这有助于了解当地耐药谱，指导经验性治疗选择，同时为地区、国家与国际监测提供支持。
实验室提供给临床团队的信息可通过多种方式进行优化。第一，以国内和国际实验室检验方法指南为指导，保证结果质量。英国实验采用了标准研究方法（Standard Methods for Investigation）。可以参加实验室认可，例如英国皇家认可委员会（UK Accreditation Service，UKAS）可对实验是否符合ISO15189标准进行认证。这些方式可能是强制性的，也可能是医疗改善过程的一部分。同时实验室还参与内部和外部质量保证计划。
考虑到抗菌药物管理工作的特定领域，实验室可以通过经常展开临床沟通，调整工作流程以满足临床服务需求。及时报告是其中之一。理想状况下，临床医生期望在需要作出临床决策时即可得到检验报告。持续的实验服务改进能够产生重要改变。例如：延长实验室的开放时间，每周工作7天并及时报告，满足医生查房或患者检查对检验结果的时效性需求。
以上几方面均被认为是提高实验室产出并最大化保证患者受益的最佳实践。另外还有一些特定的技术进步旨在进一步提高服务质量：
直到近几年，微生物实验室才在较大程度上实现了自动化。虽然分析仪已经在一起特定项目上广泛应用多年，如血清学分析或血培养孵育，相比于其他检验专业，常规细菌培养仍然是一个需要大量工作人员、相当手工的过程。然而在过去的十年中，微生物自动化取得了很大的进步，并已经得到了广泛应用。许多进展旨在实现在较低的成本水平上提高实验室标本的检测通量的改进，也对抗菌药物管理产生了积极的影响。自动化不仅可以缩短实验室报告周转时间，还能提高样本间培养条件的一致性，在某些情况下还可以提高培养样本的微生物检出。
在过去几年中，基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry，MALDI-TOFMS）得到了应用，使实验室较既往能够更加快速、且低成本地将细菌鉴定菌种水平。也使得血培养阳性后几小时内即完成鉴定成为可能，这就意味着可以快速进行目标性抗菌治疗调整。
抗菌药物敏感性试验是实验室检测的关键领域，对临床抗菌药物处方有重大影响。药敏试验的目的是提示临床医生感染是否会对特定抗菌药物治疗产生反应。这通常在报告中以“敏感”或“耐药”的形式报告。随着对抗菌药物耐药性的认识及其检测方法越来越精确，为临床提供的信息也更加可靠。相较于过去所使用的主观界值，敏感和耐药之间的阈值或折点现在可以得到更加科学地计算。该领域内的两家主要学术团体，临床与实验室标准化研究所（Committee for Laboratory Science and Investigation，CLSI）和欧洲抗菌药敏感性试验委员会（European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing，EUCAST），已经做了大量工作，以协调统一折点，并确保实验室较既往获得更多药敏试验相关信息且检测结果更加一致。
自动化药敏试验方法已经在许多实验室使用，例如VITEK™或Phoenix™及其他设备。他们既能进行菌种鉴定，也能给出细菌对各种抗菌药物的最小抑菌浓度（MIC）。这也有助于报告的标准化。尽管如此，其检测成本也高于其他检测方法。
对抗菌药物敏感性结果的限制性报告是抗菌药物管理措施之一，但各实验室之间的管理各不相同，可能并未得到充分利用。在英国，药敏试验报告普遍仅报告医学微生物学家建议临床医生处方的抗菌药物。而对于不属于当地处方集或不适用于特定感染的药物会在报告中被隐藏。这种限制性的报告行会影响临床医生的处方行为。事实上，甚至抗菌药物敏感性结果的显示顺序也能影响处方，排在首位的药物更有可能被采用。
全基因组测序是一项重要的新增长应用领域。由于新技术的研发，使全基因组测序可以在对临床有用的时间内提供测序结果，并且将测试成本降低到前所未有的水平。测序可用于创建生物体遗传“指纹”，以进行流行病学研究。基因序列还可以提供物种鉴定信息，并提示是否存在编码耐药性的基因。近期，EUCAST对这些信息的用途和局限性展开了讨论。对于某些感染，尤其是结核，测序结果可用于指导治疗，且相较于传统的分枝杆菌培养技术可以更快地提供信息。
工具包资源
网站链接
英国调查标准方法（UK Standard Methods for Investigation）
见https：//www.gov.uk/government/collections/standards-for-microbiologyinvestigations-smi
欧洲抗菌药敏感性试验委员会（European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing，EUCAST）
见http：//www.eucast.org
这两个网站提供指南范例，指导实验室如何采用标准方法进行现有诊断检验，以保证检验质量。
PDF文章
Consultation on Report from the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing（EUCAST）Subcommittee on the Role of Whole Genome Sequencing（WGS）in Antimicrobial Susceptibility Testing of Bacteria.European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing.2016
见http：//www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Consultation/2016/EUCAST_WGS_report_consultation_20160511.pdf
视频
英国抗感染化疗学会（British Society for
Antimicrobial Chemotherapy，BSAC）播客抗菌药物耐药圆桌会议系列2015年2月5日—诊断检验和抗菌管理讲座：
彼得·霍基Peter Hawkey
见http：//bsac.org.uk/PlayVideoPage.html？url=https：//s3-eu-west-1.amazonaws.com/amr050215/04ProfPeterHawkey（网站404）亚历克斯·范贝尔库姆Alex Van Belkum
见http：//bsac.org.uk/PlayVideoPage.html？url=https：//s3-eu-west-1.amazonaws.com/amr050215/08ProfAlexvanBelkum（网站404）
网站链接
教育活动示例：改进尿液试纸检测“检测或不检测”
见https：//www.youtube.com/watch？v=rZ5T1Cz7DHQ（网站无法访问）
此幻灯片资源旨在教育医务专业人员正确使用尿液试纸，从而减少无泌尿系统感染的老年患者不合理抗菌药物处方