该病主要由皮肤癣菌感染引起，其次为酵母菌和非皮肤癣菌性真菌。皮肤癣菌包括红色毛癣菌、须癣毛癣菌、絮状表皮癣菌，其中红色毛癣菌占首位。近来报道苏丹毛癣菌也是甲内型感染的致病菌。

甲真菌病多由手足癣直接传染而来的，常由红色毛癣菌、须癣毛癣菌、絮状表皮癣菌等各种真菌引起。少数由其他丝状真菌、酵母样菌及酵母菌引起，偶尔也可由孢子菌、镰刀菌及土色曲霉等引起。甲癣的易感因素还有遗传因素、系统性疾病（如糖尿病）、局部血液或淋巴液回流障碍、甲外伤或其他甲病等。

甲癣多由手足癣直接传染而来的，是真菌感染引起。但是真菌感染有遗传易感性因素的影响，而且密切接触的家人会增加感染机会。

甲癣是由一类皮肤癣菌感染引起，需经过培养才知道是哪种真菌。常常还存在不止一种真菌。即使是同一个指（趾）甲，也有可能感染两种或两种以上的致病真菌。临床上真菌直检确定真菌感染即可确诊并给予治疗。

皮肤真菌病有遗传的易感性，但不是遗传病。甲癣多由手足癣直接传染。手足癣的易感因素有遗传因素、系统性疾病（如糖尿病）、局部血液或淋巴液回流障碍、甲外伤或其他甲病等。