6．连出三计均未奏效

在战争的初始阶段，方孝孺也表示出极大的乐观。当朱允炆要求他按周朝制度改革朝政时，他显示出极大热情。建文二年，朱允炆敕旨修建的省躬殿建成。这座宫殿专门用来存放古书、圣训，类似于皇家图书馆与档案馆。大敌当前，朱允炆修建这座宫殿已属可笑。更可笑的是，朱允炆仍不以军情为重，却把省躬殿的落成典礼当作头等大事来抓。他让方孝孺稽古三朝，按尚父所说的丹书宗旨对殿内的一切陈设都撰写铭文，以取戒饬的作用。这有点像年轻的学生，见到格言警句抄下来贴到墙上，太小儿科了。

省躬殿建成不久，到了八月初一，叔侄之间的战争打了一年了，恰逢承天门遭遇一场火灾。方孝孺认为这是大事，天降灾咎，是人君有过失。再者，洪武皇帝朱元璋定下的城门之名也有问题。因此他提议将午门改成端门，把原来的端门改成应门，把承天门改成臬门，把前门改成路门。朱允炆一一准奏。

就在这时，忠于朝廷的官军与燕王的部队在河北、山东一带已经打了数十场战斗。战争开始，官军略占上风。但几个月后，燕兵渐渐掌握了战争主动权。而且朝廷中叛变的官员也渐渐多了起来。到了建文三年（1401）的三月，官军遭遇夹河之败，损失惨重。朱允炆这才意识到事情的严重性。他于闰三月初四罢免了齐泰、黄子澄的官职。表面上将他们贬出京城，实际上是让他们到处招募军士。

齐、黄二人离开京城后，方孝孺就不再只是一个讲述周礼推行政治体制改革的顾问了。他开始在朱允炆的要求下过问军事。从建文三年四月至建文四年的五月，一年时间内，就当时的战事，他向朱允炆出过三次大计，但这三次大计均未奏效。建文四年的六月初八，朱棣率领的燕兵在接连攻克淮河、长江两道天险之后，挟如雷破竹之势，终于兵临金陵城下，驻扎在城郊的龙潭。