应用CRISPR-Cas系统时一个重要的考虑是选择有效的方法将此系统递送给需要进行突变的生物。现在有一些可用的方法,选择方法时在很大程度上取决于要转染生物的特征。在植物模型中,根瘤农杆菌中的质粒通常用作载体,而在哺乳动物细胞中,优先使用gRNA-Cas9复合物[9,18]。