在支气管镜检查中有发生心律失常和心脏骤停的报道。在一些研究中使用了连续心电监测，有些还在检查前和检查后进行监测。一项研究发现，支气管镜检查使很多患者发生了明显的心动过速。另一项研究发现，检查结束时出现缺氧会伴随较多的心律失常发生，其中11%的患者会发生明显的自限性心律失常。国内金发光等回顾性分析1983年12月至2004年12月支气管镜检查和镜下治疗的23 682例患者的临床资料发现心律失常发生率约1.01‰。

Katz等发现心律失常最主要出现在支气管镜通过声门时。Katz同时发现支气管镜检查中，明显心律失常发生率高达40%，而且心律失常的发生与缺氧有关。

操作过程中患者心电监护出现各种心律失常，主要有窦性心动过速，房性、结性及室性期前收缩，亦可有T波低平，ST段下移，Q-T间期延长，严重者可出现心脏骤停。

停止支气管镜操作，吸氧，保持患者安静，避免紧张。建立静脉通路，给予抗心律失常药物，做好其他抢救准备。

对于有严重心血管疾病的患者在检查时，需要进行心电监测。因而，在进行支气管镜检查过程中，尤其是有严重心脏病史的患者，应常规进行心电监护，必要时应给以低浓度（2~3L/min）吸氧。另外，为了保证严重心律失常和心脏骤停能及时救治，支气管镜室应备有复苏设备，同时所有患者在支气管镜检查前（如果需要给予镇静剂，则应在镇静前）均应建立静脉通道，并保留至术后恢复期结束。